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技術(shù)應(yīng)用

病毒驅(qū)動型和致癌物驅(qū)動突變型頭頸癌的免疫狀況

大家好,今天菠蘿冰給大家分享一篇22+分的學習筆記。題目:病毒驅(qū)動型和致癌物驅(qū)動突變型頭頸癌的免疫狀況。一、 分析思路我們給?家簡單解讀?下分析思路:本篇學習筆記中通過單細胞RNA測序分析和多光譜免疫熒光(IF)比較了突變驅(qū)動型和病毒驅(qū)動型(HPV+)頭頸部鱗狀細胞癌HNSCC的免疫狀況

其它 | 2021-01-31 10:46 評論

充足的深度睡眠有助于清除大腦垃圾,但你真“睡好”了嗎?

與生物學中的大多數(shù)問題一樣,“我們?yōu)槭裁葱枰摺边@一問題可能會有很多版本的答案。事實上,科學家近年來在這一問題的相關(guān)領(lǐng)域內(nèi)也在持續(xù)不斷地進行探索,試圖得到一個最全面的答案。近日,來自美國西北大學(N

其它 | 2021-01-30 14:13 評論

為了躲避化療存活下來!癌細胞竟然學會了休眠!

冬眠是一種常見的生物學現(xiàn)象,在自然界中,許多動物都會通過冬眠的方式來熬過漫長的冬季,以在來年的春天復蘇,開啟下一輪春秋。在冬眠時,動物會保持著一種極端但可被調(diào)節(jié)的體溫、代謝和其它生理活動的下降,減少自身的能量消耗

2021-01-17 15:31 評論

喝咖啡確實能抗癌!多喝咖啡或可降低患前列腺癌的風險

在全世界,前列腺癌(Prostate Cancer)是男性群體中第二大常見的癌癥(僅次于皮膚癌),據(jù)世界衛(wèi)生組織(WHO)2014 年統(tǒng)計報道,前列腺癌是男性與癌癥相關(guān)的第五大死因。美國疾病控制與預防

其它 | 2021-01-16 10:45 評論

最新研究:患有PPA的人可能不會有阿爾茨海默病的記憶問題

原發(fā)性進行性失語是一種罕見的神經(jīng)退行性疾病,其特征是突出的語言問題,隨著時間的推移會惡化。大約40%的患者有潛在的阿爾茨海默病!睹绹窠(jīng)病學學會》官網(wǎng)1月13日消息一項新的研究發(fā)現(xiàn),患有原發(fā)性進行性

其它 | 2021-01-15 09:50 評論

通過整合基因組分析以鑒定肺腫瘤內(nèi)皮細胞異質(zhì)性和血管生成候選物

      大家好,今天要和大家分享的是今年二月份發(fā)表在Cancer Cell (IF:26.602)上的一篇文章,“An Integrated Gene Express

其它 | 2021-01-07 11:35 評論

這篇6+分文章教你進階疾病分型擴展分析!

大家好,今天布丁和大家分享的是一篇6+分的學習筆記;文末閱讀原文可獲得學習筆記。題目:乳腺癌近端和遠端切除的形態(tài)正常組織中四種亞型的特征一、研究背景 廣泛的乳腺X射線攝影篩查項目和改進的自我監(jiān)測醫(yī)療體系能更早地發(fā)現(xiàn)乳腺癌,保乳手術(shù)是患病女性有成效的治療方法

2021-01-06 09:33 評論

長安大學張懿璞:影像遺傳腦科學研究中的HPC問題

金翅導讀腦區(qū)異常和遺傳變異是研究精神疾病的重要標志。神經(jīng)成像技術(shù)為研究腦部異;顒犹峁┝擞行覠o創(chuàng)的方法,如磁共振成像(MRI)、腦磁圖(MEG),腦電圖(EEG)。隨著分子遺傳學的發(fā)展,特別是全基因組關(guān)聯(lián)分析(GWAS),極大地促進了復雜的疾病研究

人工智能 | 2021-01-06 09:13 評論

當孤獨時,我們的大腦發(fā)生了什么變化?

日常生活中,無論是孤寡老人還是在外獨自漂泊的年輕人,一個人在獨處時往往會不自覺的思考很多事情,并感受到孤獨和備受煎熬。有研究表明,長期處于孤獨環(huán)境中,會影響我們的睡眠,對于大腦以及心血管系統(tǒng)造成不可逆轉(zhuǎn)的損傷

其它 | 2021-01-05 11:24 評論

生發(fā)細胞激酶四激酶:保護神經(jīng)元并促進其生長

許多神經(jīng)退行性疾病,從青光眼到阿爾茨海默病,都是以軸突損傷為特征的。軸突是一種細長的突起,將電脈沖從一個神經(jīng)細胞傳導到另一個神經(jīng)細胞,促進細胞間的通訊。軸突損傷常導致神經(jīng)元損傷和細胞死亡。加州大學圣地

其它 | 2021-01-05 08:46 評論

TCGA預后基因聯(lián)合免疫浸潤

通過ESTIMATE算法計算免疫,間質(zhì)和ESTIMATE得分,并以此篩選DEGs,進行生存分析、KEGG、GO、GSEA分析,構(gòu)建PPI網(wǎng)絡(luò)并篩選hub基因,最后通過構(gòu)建風險評分(RS)模型,研究hub基因的預后價值并用驗證集進行驗證

2021-01-05 08:43 評論

非裔美國人前列腺切除術(shù)后前列腺基質(zhì)復發(fā)的計算機衍生基質(zhì)特征的圖像signature

今天螺螄粉和大家分享的是10+學習筆記。題目:非裔美國人前列腺切除術(shù)后前列腺基質(zhì)復發(fā)的計算機衍生基質(zhì)特征的圖像signature一. 研究背景數(shù)據(jù)顯示,在前列腺癌根治術(shù)后,有30%-40%的前列腺癌患者出現(xiàn)復發(fā)

其它 | 2021-01-01 21:30 評論

如何使用Survminer包優(yōu)雅的繪制生存曲線?

生存分析是臨床上較為常用的統(tǒng)計學方法,用于比較不同組別的患者在接受干預之后,生存時間的變化情況。

其它 | 2020-12-31 11:53 評論

技術(shù)文章:計量資料的統(tǒng)計描述

一、 計量資料的描述1、 頻數(shù)分布表收集到計量數(shù)據(jù)后,可通過資料整理,編制頻數(shù)分布表或簡稱頻數(shù)表(frequency table)來了解其分布規(guī)律。頻數(shù)分布(frequency distribution) 通常是針對樣本而言

其它 | 2020-12-30 09:02 評論

細微塑料顆粒具有極強滲透性,微塑料污染已波及人類胎盤!

關(guān)于微塑料污染的話題,最近越來越受到社會各界的關(guān)注,我們只知道其分布廣泛,卻對其潛在危害知之甚少。

其它 | 2020-12-28 15:13 評論

相關(guān)性熱圖 (ggcorrplot包)

?ggcorrplot包是基于ggplot2的擴展包,主要針對相關(guān)系數(shù)輸出的結(jié)果進行可視化, 同時計算相關(guān)性p-value,可以實現(xiàn)選擇顏色,文本標簽,顏色標簽,布局等的操作。?  相關(guān)系數(shù)的值在 -1~1之間,1表示強正相關(guān),0不相關(guān)

2020-12-28 10:24 評論

森林圖 (forestplot包)

在Meta分析中森林圖比較常見,但其實掌握了用R語言中的forestplot包繪制森林圖的各個用法,森林圖可以用于表示其他數(shù)據(jù)類型各組間的指標的中值和四分位距的范圍。它是在平面直角坐標系中,以一條垂直

2020-12-28 10:23 評論

乳腺癌或頭頸癌放射敏感性預測因子的分子分析

大家好,今天糖葫蘆跟大家分享一篇的6+分的學習筆記。題目:乳腺癌或頭頸癌放射敏感性預測因子的分子分析一、研究背景 近一半的癌癥是單獨或聯(lián)合放射治療,放療除了對癌癥的治療作用外,不可避免地涉及到正常組織的暴露,其中晚期和急性不良反應(yīng)是治療的劑量限制因素

2020-12-27 10:19 評論

使用DriverPower識別癌癥driver基因的綜合負荷和功能影響測試

      今天跟大家分享的是2020年發(fā)表在Nat.Commun .(IF:12.121)雜志上的一篇文章Combined burden and functional

其它 | 2020-12-24 14:21 評論

胰腺癌的放射線治療簡介

文/JMT運用化學放射線療法或化學療法治療無法切除的胰腺癌胰腺癌不僅治療困難,也是生存率最低的癌癥的一種,目前能夠根治胰腺癌的治療方法只有手術(shù)。但是,由于胰腺癌發(fā)展迅速,也有發(fā)現(xiàn)較晚的傾向,因此能夠進行手術(shù)的病例只占所有病例的20%左右,其5年生存率也僅為13%,情況較為嚴峻

2020-12-23 17:01 評論
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